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开源 vGPU 方案：HAMi,实现细粒度 GPU 切分

意琦行 included in Kubernetes
   4901 words   10 minutes 

https://img.lixueduan.com/kubernetes/cover/vgpu-hami.png

本文主要分享一个开源的 GPU 虚拟化方案：HAMi，包括如何安装、配置以及使用。
相比于上一篇分享的 TimeSlicing 方案，HAMi 除了 GPU 共享之外还可以实现 GPU core、memory 的限制，保证共享同一 GPU 的各个 Pod 都能拿到足够的资源。

1.为什么需要 GPU 共享、切分等方案？

开始之前我们先思考一个问题，为什么需要 GPU 共享、切分等方案？

或者说是另外一个问题：明明直接在裸机环境使用，都可以多个进程共享 GPU，怎么到 k8s 环境就不行了。

推荐阅读前面几篇文章：这两篇分享了如何在各个环境中使用 GPU，在 k8s 环境则推荐使用 NVIDIA 提供的 gpu-operator 快速部署环境。

GPU 环境搭建指南：如何在裸机、Docker、K8s 等环境中使用 GPU

GPU 环境搭建指南：使用 GPU Operator 加速 Kubernetes GPU 环境搭建

这两篇则分析了 device-plugin 原理以及在 K8s 中创建一个申请 GPU 的 Pod 后的一些列动作，最终该 Pod 是如何使用到 GPU 的。

Kubernetes教程(二一)—自定义资源支持：K8s Device Plugin 从原理到实现

Kubernetes教程(二二)—在 K8S 中创建 Pod 是如何使用到 GPU 的：device plugin&nvidia-container-toolkit 源码分析

看完之后，大家应该就大致明白了。

资源感知

首先在 k8s 中资源是和节点绑定的，对于 GPU 资源，我们使用 NVIDIA 提供的 device-plugin 进行感知，并上报到 kube-apiserver,这样我们就能在 Node 对象上看到对应的资源了。

就像这样：

root@liqivm:~# k describe node gpu01|grep Capacity -A 7
Capacity:
  cpu:                128
  ephemeral-storage:  879000896Ki
  hugepages-1Gi:      0
  hugepages-2Mi:      0
  memory:             1056457696Ki
  nvidia.com/gpu:     8
  pods:               110

可以看到，该节点除了基础的 cpu、memory 之外，还有一个nvidia.com/gpu: 8 信息，表示该节点上有 8 个 GPU。

资源申请

然后我们就可以在创建 Pod 时申请对应的资源了，比如申请一个 GPU：

apiVersion: v1
kind: Pod
metadata:
  name: gpu-pod
spec:
  containers:
  - name: gpu-container
    image: nvidia/cuda:11.0-base   # 一个支持 GPU 的镜像
    resources:
      limits:
        nvidia.com/gpu: 1          # 申请 1 个 GPU
    command: ["nvidia-smi"]         # 示例命令，显示 GPU 的信息
  restartPolicy: OnFailure

apply 该 yaml 之后，kube-scheduler 在调度该 Pod 时就会将其调度到一个拥有足够 GPU 资源的 Node 上。

同时该 Pod 申请的部分资源也会标记为已使用，不会再分配给其他 Pod。

到这里，问题的答案就已经很明显的。

  • 1）device-plugin 感知到节点上的物理 GPU 数量，上报到 kube-apiserver
  • 2）kube-scheduler 调度 Pod 时会根据 pod 中的 Request 消耗对应资源

即：Node 上的 GPU 资源被 Pod 申请之后，在 k8s 中就被标记为已消耗了，后续创建的 Pod 会因为资源不够导致无法调度。

实际上：可能 GPU 性能比较好，可以支持多个 Pod 共同使用，但是因为 k8s 中的调度限制导致多个 Pod 无法正常共享。

因此，我们才需要 GPU 共享、切分等方案。

上一篇文章一文搞懂 GPU 共享方案： NVIDIA Time Slicing 中给大家分享了一个 GPU 共享方案。

可以实现多个 Pod 共享同一个 GPU，但是存在一个问题：Pod 之间并未做任何隔离，每个 Pod 能用到多少 GPU core、memory 都靠竞争，可能会导致部分 Pod 占用大部分资源导致其他 Pod 无法正常使用的情况。

今天给大家分享一个开源的 vGPU 方案 HAMi。

ps：NVIDIA 也有自己的 vGPU 方案，但是需要 license

2. 什么是 HAMi？

HAMi 全称是：Heterogeneous AI Computing Virtualization Middleware，HAMi 给自己的定位或者希望是做一个异构算力虚拟化平台。

原 第四范式 k8s-vgpu-scheduler, 这次改名 HAMi 同时也将核心的 vCUDA 库 libvgpu.so 也开源了。

但是现在比较完善的是对 NVIDIA GPU 的 vGPU 方案，因此我们可以简单认为他就是一个 vGPU 方案。

整体架构如下：

https://img.lixueduan.com/kubernetes/vgpu/hami-arch.png

可以看到组件还是比较多的，涉及到 Webhook、Scheduler、Device Plugin、HAMi-Core 等等。

这篇文章只讲使用，因此架构、原理就一笔带过，后续也会有相关文章,欢迎关注~。

Feature

使用 HAMi 最大的一个功能点就是可以实现 GPU 的细粒度的隔离，可以对 core 和 memory 使用 1% 级别的隔离。

具体如下：

apiVersion: v1
kind: Pod
metadata:
  name: gpu-pod
spec:
  containers:
    - name: ubuntu-container
      image: ubuntu:18.04
      command: ["bash", "-c", "sleep 86400"]
      resources:
        limits:
          nvidia.com/gpu: 1 # 请求1个vGPUs
          nvidia.com/gpumem: 3000 # 每个vGPU申请3000m显存 （可选，整数类型）
          nvidia.com/gpucores: 30 # 每个vGPU的算力为30%实际显卡的算力 （可选，整数类型）
  • nvidia.com/gpu：请求一个 GPU
  • nvidia.com/gpumem：只申请使用 3000M GPU Memory
  • nvidia.com/gpucores：申请使用 30% 的 GPU core，也就是该 Pod 只能使用到 30% 的算力

相比于上文分享了 TimeSlicing 方案，HAMi 则是实现了 GPU core 和 memory 的隔离。

在开源方案里面已经算是比较优秀的了。

Design

HAMi 实现GPU core 和 memory 隔离、限制是使用的 vCUDA 方案，具体设计如下：

https://img.lixueduan.com/kubernetes/vgpu/hami-core-design.png

HAMi 使用的是软件层面的 vCUDA 方案，对 NVIDIA 原生的 CUDA 驱动进行重写(libvgpu.so)，然后挂载到 Pod 中进行替换，然后在自己的实现的 CUDA 驱动中对 API 进行拦截，实现资源隔离以及限制的效果。

例如：原生 libvgpu.so 在进行内存分配时，只有在 GPU 内存真的用完的时候才会提示 CUDA OOM，但是对于 HAMi 实现的 libvgpu.so 来说，检测到 Pod 中使用的内存超过了 Resource 中的申请量就直接返回 OOM，从而实现资源的一个限制。

然后在执行 nvidia-smi 命令查看 GPU 信息时，也只返回 Pod Resource 中申请的资源，这样在查看时也进行隔离。

ps：需要对 CUDA 和 NVML 的部分 API 拦截。

3. HAMi 部署

HAMi 提供了 Helm Chart 安装也是比较简单的。

部署 GPU Operator

需要注意的是 HAMi 会依赖 NVIDIA 的那一套，因此推荐先部署 GPU-Operator。

参考这篇文章 –> GPU 环境搭建指南：使用 GPU Operator 加速 Kubernetes GPU 环境搭建

部署好 GPU Operator 之后在部署 HAMi。

部署 HAMi

首先使用 helm 添加我们的 repo

helm repo add hami-charts https://project-hami.github.io/HAMi/

随后，使用下列指令获取集群服务端版本

这里使用的是 v1.27.4 版本

kubectl version

在安装过程中须根据集群服务端版本（上一条指令的结果）指定调度器镜像版本，例如集群服务端版本为 v1.27.4，则可以使用如下指令进行安装

helm install hami hami-charts/hami --set scheduler.kubeScheduler.imageTag=v1.27.4 -n kube-system

通过kubectl get pods指令看到 vgpu-device-plugin 与 vgpu-scheduler 两个pod 状态为Running 即为安装成功

root@iZj6c5dnq07p1ic04ei9vwZ:~# kubectl get pods -n kube-system|grep hami
hami-device-plugin-b6mvj                          2/2     Running   0          42s
hami-scheduler-7f5c5ff968-26kjc                   2/2     Running   0          42s

自定义配置

官方文档：HAMi-config-cn.md

你可以在安装过程中，通过-set来修改以下的客制化参数，例如：

helm install vgpu vgpu-charts/vgpu --set devicePlugin.deviceMemoryScaling=5 ...
  • devicePlugin.deviceSplitCount： 整数类型，预设值是 10。GPU 的分割数，每一张GPU 都不能分配超过其配置数目的任务。若其配置为N的话，每个 GPU 上最多可以同时存在 N 个任务。
  • devicePlugin.deviceMemoryScaling: 浮点数类型，预设值是1。NVIDIA 装置显存使用比例，可以大于1（启用虚拟显存，实验功能）。对于有 M显存大小的 NVIDIA GPU，如果我们配置devicePlugin.deviceMemoryScaling参数为 S ，在部署了我们装置插件的Kubenetes 集群中，这张 GPU 分出的 vGPU 将总共包含 S * M 显存。
  • devicePlugin.migStrategy: 字符串类型，目前支持"none“与“mixed“两种工作方式，前者忽略 MIG 设备，后者使用专门的资源名称指定 MIG 设备，使用详情请参考mix_example.yaml，默认为"none"
  • devicePlugin.disablecorelimit: 字符串类型，“true"为关闭算力限制，“false"为启动算力限制，默认为"false”
  • scheduler.defaultMem: 整数类型，预设值为 5000，表示不配置显存时使用的默认显存大小，单位为 MB
  • scheduler.defaultCores: 整数类型(0-100)，默认为0，表示默认为每个任务预留的百分比算力。若设置为 0，则代表任务可能会被分配到任一满足显存需求的 GPU 中，若设置为100，代表该任务独享整张显卡
  • scheduler.defaultGPUNum: 整数类型，默认为1，如果配置为0，则配置不会生效。当用户在 pod 资源中没有设置 nvidia.com/gpu 这个 key 时，webhook 会检查 nvidia.com/gpumem、resource-mem-percentage、nvidia.com/gpucores 这三个 key 中的任何一个 key 有值，webhook 都会添加 nvidia.com/gpu 键和此默认值到 resources limit中。
  • resourceName: 字符串类型, 申请vgpu个数的资源名, 默认: “nvidia.com/gpu”
  • resourceMem: 字符串类型, 申请vgpu显存大小资源名, 默认: “nvidia.com/gpumem”
  • resourceMemPercentage: 字符串类型，申请vgpu显存比例资源名，默认: “nvidia.com/gpumem-percentage”
  • resourceCores: 字符串类型, 申请vgpu算力资源名, 默认: “nvidia.com/cores”
  • resourcePriority: 字符串类型，表示申请任务的任务优先级，默认: “nvidia.com/priority”

除此之外，容器中也有对应配置

  • GPU_CORE_UTILIZATION_POLICY: 字符串类型，“default”, “force”, “disable” 代表容器算力限制策略， “default"为默认，“force"为强制限制算力，一般用于测试算力限制的功能，“disable"为忽略算力限制
  • ACTIVE_OOM_KILLER: 字符串类型，“true”, “false” 代表容器是否会因为超用显存而被终止执行，“true"为会，“false"为不会

我们只是简单 Demo 就不做任何配置直接部署即可。

4. 验证

查看 Node GPU 资源

类似于上一篇分享的 TimeSlicing 方案，在安装之后，Node 上可见的 GPU 资源也是增加了。

环境中只有一个物理 GPU，但是 HAMi 默认会扩容 10 倍，理论上现在 Node 上能查看到 1*10 = 10 个 GPU。

默认参数就是切分为 10 个，可以设置。

$ kubectl get node xxx -oyaml|grep capacity -A 7
  capacity:
    cpu: "4"
    ephemeral-storage: 206043828Ki
    hugepages-1Gi: "0"
    hugepages-2Mi: "0"
    memory: 15349120Ki
    nvidia.com/gpu: "10"
    pods: "110"

验证显存和算力限制

使用以下 yaml 来创建 Pod，注意 resources.limit 除了原有的 nvidia.com/gpu 之外还新增了 nvidia.com/gpumem 和 nvidia.com/gpucores，用来指定显存大小和算力大小。

  • nvidia.com/gpu：请求的 vgpu 数量，例如 1
  • nvidia.com/gpumem ：请求的显存数量，例如 3000M
  • nvidia.com/gpumem-percentage：显存百分百，例如 50 则是请求 50%显存
  • nvidia.com/priority: 优先级，0 为高，1 为低，默认为 1。
    • 对于高优先级任务，如果它们与其他高优先级任务共享 GPU 节点，则其资源利用率不会受到 resourceCores 的限制。换句话说，如果只有高优先级任务占用 GPU 节点，那么它们可以利用节点上所有可用的资源。
    • 对于低优先级任务，如果它们是唯一占用 GPU 的任务，则其资源利用率也不会受到 resourceCores 的限制。这意味着如果没有其他任务与低优先级任务共享 GPU，那么它们可以利用节点上所有可用的资源。

完整 gpu-test.yaml 内容如下：

apiVersion: v1
kind: Pod
metadata:
  name: gpu-pod
spec:
  containers:
    - name: ubuntu-container
      image: ubuntu:18.04
      command: ["bash", "-c", "sleep 86400"]
      resources:
        limits:
          nvidia.com/gpu: 1 # 请求1个vGPUs
          nvidia.com/gpumem: 3000 # 每个vGPU申请3000m显存 （可选，整数类型）
          nvidia.com/gpucores: 30 # 每个vGPU的算力为30%实际显卡的算力 （可选，整数类型）

Pod 能够正常启动

root@iZj6c5dnq07p1ic04ei9vwZ:~# kubectl get po
NAME      READY   STATUS    RESTARTS   AGE
gpu-pod   1/1     Running   0          48s

进入 Pod执行 nvidia-smi 命令，查看 GPU 信息，可以看到展示的限制就是 Resource 中申请的 3000M。

root@iZj6c5dnq07p1ic04ei9vwZ:~# kubectl exec -it gpu-pod -- bash
root@gpu-pod:/# nvidia-smi
[HAMI-core Msg(16:139711087368000:libvgpu.c:836)]: Initializing.....
Mon Apr 29 06:22:16 2024
+-----------------------------------------------------------------------------------------+
| NVIDIA-SMI 550.54.14              Driver Version: 550.54.14      CUDA Version: 12.4     |
|-----------------------------------------+------------------------+----------------------+
| GPU  Name                 Persistence-M | Bus-Id          Disp.A | Volatile Uncorr. ECC |
| Fan  Temp   Perf          Pwr:Usage/Cap |           Memory-Usage | GPU-Util  Compute M. |
|                                         |                        |               MIG M. |
|=========================================+========================+======================|
|   0  Tesla T4                       On  |   00000000:00:07.0 Off |                    0 |
| N/A   33C    P8             15W /   70W |       0MiB /   3000MiB |      0%      Default |
|                                         |                        |                  N/A |
+-----------------------------------------+------------------------+----------------------+

+-----------------------------------------------------------------------------------------+
| Processes:                                                                              |
|  GPU   GI   CI        PID   Type   Process name                              GPU Memory |
|        ID   ID                                                               Usage      |
|=========================================================================================|
|  No running processes found                                                             |
+-----------------------------------------------------------------------------------------+
[HAMI-core Msg(16:139711087368000:multiprocess_memory_limit.c:434)]: Calling exit handler 16

根据最后的日志就是 HAMi 的 CUDA 驱动打印的。

[HAMI-core Msg(16:139711087368000:multiprocess_memory_limit.c:434)]: Calling exit handler 16

5. FAQ

多卡场景

对于多卡场景，只需要申请多个 vGPU 即可，和普通 GPU 使用方式一样，就像这样：

ps：应该是不能超过节点上的物理 GPU 数

apiVersion: v1
kind: Pod
metadata:
  name: gpu-pod
spec:
  containers:
    - name: ubuntu-container
      image: ubuntu:18.04
      command: ["bash", "-c", "sleep 86400"]
      resources:
        limits:
          nvidia.com/gpu: 2 # 请求2个vGPUs
          nvidia.com/gpumem: 3000 # 每个vGPU申请3000m显存 （可选，整数类型）
          nvidia.com/gpucores: 30 # 每个vGPU的算力为30%实际显卡的算力 （可选，整数类型）

申请了两个 vGPU，每个 3000M 内存和 30% 算力。

性能损耗

根据 HAMi 官方测试结果 来看，不同应用场景，性能损耗也不同，但是最大不会超过 10%。

https://img.lixueduan.com/kubernetes/vgpu/hami-benchmark_inf.png

https://img.lixueduan.com/kubernetes/vgpu/hami-benchmark_train.png

算力隔离

根据 HAMi 官方描述，是可以实现 1% 粒度的算力隔离，就像这样：

nvidia.com/gpucores: 30 # 每个vGPU的算力为30%实际显卡的算力 （可选，整数类型）

但是使用下来，算力确实有所限制，但是并不是特别准确。

相关 Issue：算力限制不生效，官方人员提到：“算力限制不是说设置20%就只用20%，它是在一个周期内平均算下来是20%。”

应该是算力隔离部分从 CUDA 层面实现本身就有所限制,只能限制周期内的平均值。

6. 小结

本文主要分享了开源 vGPU 方案 HAMi，并通过简单 Demo 进行了验证。

为什么需要 GPU 共享、切分？

在 k8s 中使用默认 device plugin 时，GPU 资源和物理 GPU 是一一对应的，导致一个物理 GPU 被一个 Pod 申请后，其他 Pod 就无法使用了。

为了提高资源利用率，因此我们需要 GPU 共享、切分等方案。

HAMi 大致实现原理

通过替换容器中的 libvgpu.so 库，实现 CUDA API 拦截，最终实现对 GPU core 和 memory 的隔离和限制。

更加详细的原理分析，可以期待后续文章~

最后再贴一下相关文章，推荐阅读：

Updated on 2024-10-09
 Kubernetes, GPU
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